Dans le double-épisode "Dreamland" ("Zone 51") se cachent plusieurs références à Star Trek:
- Scully : "Dis-moi, au fait, au sujet de cette source clandestine qui t'a contacté, qu'est ce qui te dit qu'il ne s'agit pas encore d'un de ces barjots dont le savoir encyclopédique concernant une éventuelle vie extra-terrestre dérive exclusivement des multiples rediffusions de Star Trek"
- On découvre une séquence où Mulder, lorsqu'il était enfant, était déguisé en Spock, portant un uniforme scientifique de Starfleet et des oreilles vulcaines.
- Mulder : "Tu as raison Scully, encore un barjot qui a trop regardé Star Trek"
Un équipage de Triannons sauvés d'un vaisseau en perdition par l'Enterprise se révèle être formé d'extrêmistes religieux qui piratent le NX-01 pour éradiquer les 'hérétiques' sur leur monde.