John Frederick Paxton était le propriétaire et l'administrateur de la colonie minière d'Orpheus située sur la Lune et construite par son père en 2090. Mais il est avant tout connu pour être le fondateur et le chef de Terra Prime, une organisation xénophobe radicale qui prône la pureté de la race humaine. Il s'avère cependant qu'il a lui-même bénéficié d'une thérapie génique Rigelienne car il souffrait du syndrome de Taggart.

Fervent admirateur du colonel Philip Green (troisième guerre mondiale), Paxton base tous les principes de Terra Prime sur les discours et les idéologies de ceui-ci.

Fidel à ses idéaux et pour justifier son organisation, Paxton fait concevoir un clone binaire Humain-Vulcain à partir des gènes du commandeur Tucker et de T'pol. Il utilise l'enfant pour démontrer le danger du métissage allégeant que le croisement avec les espèces étrangères induit une « pollution » et une « dissolution » du génome humain et conduira inévitablement à l'extinction.

Paxton proclamait haut et fort que Terra Prime était dévouée à la protection de la vie et toute sa diversité, mail il n'hésite pas à faire assassiner ceux qui interfèrent avec ses projets. Ainsi, Susan Khouri qui avait déserté Terra Prime pour avertir Sarfleet des intentions de Paxton fut tuée par l'un de ses sbires, mais heureusement elle eut le temps de remettre un échantillon de cheveux de l'enfant à T'pol. Mercer, un autre technicien médical fut assassiné, car il démontrait un trop grand attachement envers l'enfant qu'il avait créé.

Pour « convaincre » Starfleet que Terra Prime était prête à tout pour protéger la race Hunaine, Paxton fit déplacé la colonie minière* sur Mars pour prendre le contrôle du rayon Verteron. De cette position stratégique, il exigea que tous les étrangers présents sur Terre et dans le système Solaire quitte immédiatement une fois le délai de 24 heures écoulé, sans quoi il détruirait le siège de Starfleet Command. Il considérait que Starfleet était responsable de l'arrivée des étrangers sur Terre et voulait de plus former une coalition avec les différentes planètes connues.

*La colonie d'Orpheus était en fait un vaisseau spatial autonome et possédant des moteurs de distorsions. 

Une équipe constituée du capitaine Archer, Malcolm Reed, Travis Mayweather et le Dr Phlox réussit à infiltrer la colonie dans le but d'arrêter Paxton avant qu'il n'ait le temps d'utiliser le rayon. Paxton fut effectivement arrêté et placé en détention.

Ironiquement, les actions de Paxton ont contribué à la création de la Fédération en ce sens qu'elles ont apporté une meilleure compréhension de la peur qu'ont les humains pour ce qui leur est étranger.