Il devient ingénieur à bord du Voyager lors du périple du vaisseau dans le quadrant Delta. Le Capitaine Janeway a en effet décidé de fusionné les équipages du Voyager et des maquisards.
À l'instar de Seska, il trahit l'équipage de son propre bâtiment pour le compte des Kazons tout d'abord en vendant des informations confidentielles, puis en sabotant certains systèmes de la salle des machines du Voyager.
Démasqué par Neelix, il tente de le tuer. Mais Neelix réussit, après une courte bataille à faire basculer Jonas par-dessus la rambarde, celui-ci est alors vaporisé par une fuite de plasma provoquée par leur affrontement.
Lorsque Quark vend à Odo un bébé métamorphe, celui-ci décide de l'adopter et de le soigner. Odo entreprend de lui apprendre à changer de forme, et ne cache pas son mécontentement quand le Docteur Mora, le scientifique Bajoran qui l'avait jadis étudié, arrive pour l'aider. Dans le même temps, Kira accouche enfin de l'enfant de Keiko et Miles O'Brien.
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Lorsque Quark vend à Odo un bébé métamorphe, celui-ci décide de l'adopter et de le soigner. Odo entreprend de lui apprendre à changer de forme, et ne cache pas son mécontentement quand le Docteur Mora, le scientifique Bajoran qui l'avait jadis étudié, arrive pour l'aider. Dans le même temps, Kira accouche enfin de l'enfant de Keiko et Miles O'Brien. 
